Программа «Летняя школа»

Конкурс Эссе

Основой Эссе являются:

1. Публикации по теме проекта в российской и международной научной периодической литературе, ПРЕДПОЧТИТЕЛЬНО в рецензируемых журналах и сборниках (рецензируемых Web of Science, SCOPUS, PubMed, Agricola, CABI).
2. Материалы справочников и учебных пособий по генетике, геномике, молекулярной биологии, селекции растений, биотехнологии, фитопатологии, защите растений, и других специальных дисциплин.
3. Результаты собственных научных исследований (при их наличии).

Структура Эссе

Эссе должно включать следующие разделы: титульный лист, реферат, содержание (по желанию), введение, аналитический обзор литературы, заключение (выводы) и библиографический список.

Текст работы: шрифт Times New Roman (размер 12 pt), межстрочный интервал - 1, абзацный отступ 1,27 см, выравнивание – по ширине, все поля – 20 мм.

Титульный лист

[На титульном листе приводятся следующие сведения: наименование учебного заведения, института, факультет, кафедры, название темы работы, фамилия и имя автора, а также контактные адрес электронной почты и номер телефона].

Реферат

[В Реферате приводится название Эссе и сведения об объеме (стр.), количестве рисунков, таблиц, источников использованной литературы. Далее в реферате приводятся ключевые слова, и текст которые характеризуют основное содержание работы (от 5 до 15 предложений). Текст реферата включает: объект исследования, цель работы, основные выводы. Оптимальный объем реферата – 0,5 страницы].

Содержание

[План Эссе по разделам (если такие есть)].

Введение

[Дается краткая характеристика состояния изучаемого вопроса (проблемы). Приводится экономическое значение решения проблемы. Объем раздела – до 2 страниц].

Основная часть Эссе

Заключение

[Кратко обобщают выводы, сделанные на основании анализа литературы и данных по теме исследования].

Оформление библиографического списка

[Список должен содержать источники, которые были использованы при выполнении работы и на которые имеются ссылки в тексте. Ссылки на литературу в тексте следует давать либо порядковым номером по списку источников, выделенным квадратным скобками, либо с указанием автора и года издания через точку с запятой].

Темы по выбору для подготовки Эссе на конкурс «Генетика, селекция и биотехнология картофеля, зерновых и овощных культур, и экологичные методы защиты растений».

Селекция, генетика и геномика растений:

1. Современные платформы для секвенирования ДНК: основные направления развития технологий и сферы применения в биологии.
2. Методы паспортизации сортов картофеля и других вегетативно-размножаемых культур (SSR, SNP, NGS).
3. Marker-assisted selection: применение для селекции картофеля и других культур. Оценка выигрыша во времени при концентрации полезных генов в одном генотипе для разных типов маркеров.
4. Молекулярно-филогенетический анализ как метод для подбора родительских пар при скрещивании растений
5. Микрочипы для ПЦР анализа - их исследование в диагностике, молекулярной и клеточной биологии
6. Картирование генома растений: методы и применение результатов исследований.
7. Методы геномного редактирования и получения генетически-модифицированных растений
8. Методы идентификации полезных мутаций в геноме растений
9. Корреляция между реакцией растений к патогенам и физиологическим стрессам на примере пасленовых, капустных культур и злаков
10. Генетический контроль расово-специфической устойчивости к фитопатогенам у пасленовых культур.
11. Генетический контроль расово-специфической устойчивости к фитопатогенам у зерновых злаков.
12. Интерференция РНК: механизмы и применение в сельском хозяйстве.

Биотехнология растений:

1. Новые направления сельскохозяйственной биотехнологии: использование данных полногеномного секвенирования для регуляции экспрессии генов, отбора полезных генов и их редактирования.
2. Современные технологии для получения генетически-модифицированных растений и анализа их безопасности.
3. Методы стимулирования морфогенеза и соматического эмбриоидогенеза растений в культуре in vitro.
4. Альтернативные методы ускоренного создания гомозиготных рекомбинантных линий растений.
5. Клеточная селекция для получения растений, устойчивых к абиотическим и биотическим стрессам.
6. Методы генетической инженерии для создания исходных форм растений для селекции.
7. Методы биотехнологии для массового размножения ценных генотипов растений.
8. Методы оздоровления растений от вирусной и бактериальной инфекции на основе методов культивирования in vitro.
9. Молекулярно-генетическое маркирование и картирование признаков и свойств растений.
10. Возможности биотехнологических методов для создания новых генотипов растений, устойчивых к биотическим стрессам.
11. Сомаклональная изменчивость растений при вегетативном размножении и при клонировании в культуре in vitro.
12. Методы получения «съедобных» вакцин.
13. Технологии получения искусственных семян.
14. Методы генетической трансформации и редактирования растений.
15. Создание генетически-модифицированных растений: законодательная регуляция в разных странах.
16. Биотехнологические подходы в решении экологических проблем: растения-индикаторы загрязнения и растения, накапливающие вредные вещества.
17. Биотехнологические методы сохранения генофонда растений.
18. Биотехнология и биоэнергетика.
19. Биотехнология в микробиологии для использования почвенного плодородия.

Фитопатология, диагностика фитопатогенов:

1. Особенности систематики фитопатогенных бактерий: определение патовариантов и их соотношение с видами и внутривидовыми подразделениями бактерий.
2. Факторы вирулентности фитопатогенов: токсины, экзоферменты, белки-эффекторы, молекулы quorum-sensing и их использование для контроля фитопатогенов.
3. Анализ геномов фитопатогенов для поиска мишеней для средств защиты растений.
4. Генетическое разнообразие, круг хозяев и методы диагностики вирусов, поражающих картофель.
5. Этиология заболевания растений, круг хозяев и методы диагностики подвида Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus, поражающего картофель.
6. Генетическое разнообразие, круг хозяев и методы диагностики возбудителей черной ножки картофеля Pectobacterium spp. и Dickeya spp.
7. Генетическое разнообразие, круг хозяев и методы диагностики карантинного патогена картофеля и томатов Ralstonia solanacearum.
8. Этиология заболеваний растений, круг хозяев и методы диагностики расы P подвида Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, поражающей картофель и томат
9. Этиология заболевания растений, круг хозяев и методы диагностики подвида Clavibacter michiganensis subsp. nebraskenis, поражающего кукурузу.
10. Этиология заболеваний растений, круг хозяев и методы диагностики видов и патовариантов группы Pseudomonas syringae– патогена плодовых, овощных и зерновых культур.
11. Этиология заболеваний растений, круг хозяев и методы диагностики бактерий рода Xanthomonas spp. – патогенов плодовых, овощных и зерновых культур.
12. Этиология заболеваний растений, круг хозяев и методы диагностики рода Potyvirus – патогенов плодовых, овощных и зерновых культур.
13. Взаимодействие с другими вирусами фитопатогенов рода Potyvirus
14. Влияние климатических факторов на распространение и вредоносность вирусных, бактериальных и грибных патогенов растений.
15. Насекомые – переносчики вирусных и бактериальных болезней растений.
16. Нематоды – переносчики вирусных и бактериальных болезней растений.
17. Грибы, оомицеты и простейшие - переносчики вирусных и бактериальных болезней растений.
18. Выживание фитопатогенных микроорганизмов в окружающей среде – роль вторичных хозяев и способности к сапрофитному существованию.
19. Методы анализа полных секвенированных геномов и данных мультилокусного анализа фитопатогенных грибов, вирусов и бактерий для создания специфичных праймеров и зондов для ПЦР диагностики.
20. Создание и валидация ПЦР диагностикумов для фитопатогенов.
21. Создание и валидация диагностикумов для фитопатогенов, основанных на изотермической амплификации ДНК.
22. Современные технические средства для полевой диагностики фитопатогенов.

Экологизация средств защиты растений: системы раннего обнаружения эпифитотий и принятия решений, наночастицы, бактерии-антагонисты, бактериофаги, РНК:

1. Системы прогноза эпифитотий и принятия решений на примере возбудителей фитофтороза картофеля и септориоза пшеницы
2. Дистанционная диагностика физиологического состояния растений и развития болезней и вредителей: анализ спутниковых и аэрофотографий, мультиспектральный анализ, использование БПЛА.
3. Синтез и использование наночастиц металлов с антибактериальными и антигрибными свойствами.
4. Модификация свойств наночастиц для применения в защите растений.
5. Вещества, усиливающие действие пестицидов.
6. Поиск бактерий-антагонистов в природе и их отбор по эффективности для защиты растений.
7. Бактериофаги: поиск в природе, оценка активности, создание коктейлей, и применение в защите растений.
8. Сочетание бактерий-антагонистов и бактериофагов в препаратах для защиты растений.
9. Использование пост-геномных технологий управления экспрессией генов растений для защиты от болезней и повышения урожайности.